Deshacer convenio regulador por reconciliación

Hola buenas, mi duda es la siguiente. Me he divorciado hace dos meses , ya hemos firmado el convenio regulador en el juzgado. La madre se ha quedado la custodia de los dos niños de 6 y 10 años y se ha ido a casa de los abuelos. Yo he llegado a un acuerdo económico con mi ex-esposa y me he quedado con el hogar.
Además, tengo que pasar mensualmente una pensión de 300 euros.
Hasta ahí, todo normal... el caso es que mi ex-esposa me dice que desea volver con los niños y me devolvería la pension y aportaría algo al gasto del hogar.
Seguimos divorciados, pero juntos. Mi duda es si más adelante si volviésemos a querer irse fuera del hogar podría objetar que ha estado en el hogar y por tema de menores tener yo algún problema... He pensado en hacer un documento firmado por ambos ante notario por si acaso...
Querría aclarar si podría tener problemas a pesar de yo haber satisfecho el convenio regulador ante el juzgado. gracias