División vivienda con % diferente

Hace años compré un piso con la que era mi pareja.
Al realizar la compra, puse un capital mío para que no tuvieramos que pedir tanta hipoteca
El % en que quedó la vivienda fue un 61%/39%
El dinero que faltaba lo pedimos al banco (yo entendía que al 50% puesto que si no era así yo pagaba más por el piso que él).

Ahora, después de años, nos separamos y pide que sólo se le descuente el 39% de lo que queda de la hipoteca y no el 50%....

REalmente si hago los números con ese % me da que yo perdí mis 48.000 euros que aporté inicialmente.
Gracais por revisar mi caso