cambian plusvalía pagada

Hola,
En Noviembre del 2017 murió mi madre y mi hermano y yo heredamos la vivienda en la que vivía. En febrero del 2018. vendimos esa vivienda por el mismo valor por el que estaba escriturado, hicimos la auto liquidación de la plusvalía, por lo que al hacer la declaración de hacienda nos salia como pérdida de capital.
Hoy he recibido una carta del ayuntamiento de Barcelona en la que me pone que como no habían pasado 3 años desde el fallecimiento de mi madre (el piso originalmente era de mi abuela que murió en 1989, y mi madre pagó la plusvalia correspondiente en 2015) y la venta no tenia derecho al 95% de bonificación que me aplicaron cuando pagué la plusvalía, y ahora me hacen otra liquidación con lo que me corresponde pagar descontando, eso sí,lo que ya había pagado con anterioridad, y el importe es 20 veces superior a lo que pagué.
¿Pueden obligarme a pagar la plusvalía?. Gracias.